知网查重格式错乱可能由于文本编码不一致、文档格式不规范、复制粘贴操作不当等多种原因导致。首先，检查文本编码是否统一，建议使用UTF-8编码以避免格式错乱。其次，规范文档格式，避免使用特殊符号和格式，保持文档整洁。另外，复制粘贴时要注意格式是否保持一致，可以尝试使用纯文本方式进行复制，再进行格式调整。同时，及时保存文档并进行查重，可以有效减少格式错乱的发生。

为避免知网查重格式错乱问题，建议在编辑文稿时注意文本编码的统一、文档格式的规范和复制粘贴操作的谨慎。确保文本编码为UTF-8格式，文档格式简洁规范，避免使用特殊符号和格式。在进行复制粘贴操作时，最好使用纯文本方式，再根据需要进行格式调整。另外，定期保存文档并进行查重，可以及时发现并解决格式错乱问题，提高文章查重准确率。